在翡翠冲浪中，小智一行人在海上遇到了风暴。为了躲避风浪，他们不得不潜入海面，试图在海底寻找出路。
当他们在海里遇到一群神奇宝贝时，他们似乎对这次经历很满意。当听到小智说要离开大海时，这些神奇宝贝们显得非常紧张和不安。
这时，一条神秘的小丑鱼突然出现。他告诉小智，他的同伴正在被一股巨大的力量吞噬。如果他不尽快返回陆地，所有人都会陷入危险。
小丑鱼建议小智带着他的神奇宝贝一起去陆地。于是，他们登上了小丑鱼船，开始了他们的冒险之旅。
途中，他们遇到了许多奇怪的海洋生物。一只名叫波的水生神奇宝贝甚至将他们的船撞成了两半！不过，这并没有阻止他们的热情——阿波的朋友们仍然欢迎他们的到来。
很快，他们发现这是一种奇怪的水母组合。这些水母虽然体型较小，但数量却不少。他们还可以用身上的刺来防御攻击！
就在众人一头雾水的时候，一只名叫卡比的海洋生物突然从水中跳了出来。它告诉大家，曾经是一名训练员，但现已退出比赛。现在，它正在帮助新培训师！
接下来，卡比兽开始展现自己的技能。它的尾巴上，出现了一根长长的、像鞭子一样的触手。只要尾巴一抖，就能让对手瘫痪……
看到这一幕，大家都觉得卡比的技能很厉害，让他来演示一下。就在这时，一场突如其来的风暴降临在了众人的面前。而在这股强风之中，就连一向强大的卡比兽也失去了平衡……
眼看着事态越来越严重，众人决定赶紧离开这里！然而，此时此刻——
一直沉默的阿波突然开口说道：‘我明白了。'然后它就向海岸游去！紧接着，其他水母也跟着阿波走了。
原来，这是阿宝的特殊能力！这种能力可以让他在大海中快速穿梭，躲避风雨。当我们在海上遇到风雨时，只有它会出现在我们身边！
就这样，在小丑鱼的带领下，大家终于来到了一片空旷的土地！与此同时，他们还结识了传奇冠军健身房领袖——Dr.橡木！
见到医生后，小智立即向他询问体操比赛的情况。没想到大木博士竟然主动提出帮助小智赢得挑战健身房的权利。
听到这个消息后，大家都很高兴。因为大家都知道，如果你能够在比赛中击败冠军道馆馆主，就意味着你将获得晋级的资格！
于是，在大木的帮助下，大家很快就准备好了！是时候见证奇迹了！
最终的结果是什么？
